En 1988, il inaugure la ligne de parfums pour femme avec "Kenzo de Kenzo", "Parfum d'été", "Le monde est beau" et "L'eau par Kenzo", tandis que la première fragrance masculine, "Kenzo pour Homme", est présentée en 1991. "FlowerbyKenzo", quant à elle lancée en 2000, est devenue d'emblée une fragrance phare pour la marque Kenzo Parfums. En 2001, la marque s'étend également vers une ligne de soins pour la peau, et naît ainsi KenzoKI.
En 1999, Kenzo Takada annonce son retrait, laissant ses assistants à la tête de sa maison de mode. En 2003, le designer italien Antonio Marras rejoint la marque et est nommé directeur créatif en décembre 2008. Deux ans plus tard, Kenzo se tourne vers un type de design différent avec le lancement de Gokan Kobo, une gamme d'articles de table, d'objets pour la maison et de meubles.
En juillet 2011, il a été annoncé que Marras quitterait sa direction créative chez Kenzo et que lui succéderaient Humberto Leon et Carol Lim, le duo derrière la boutique culte Opening Ceremony. Leur objectif a été d'emblée de bousculer la 'jungle' de la mode, et c'est ce qui s'est produit : leur chemise avec le tigre iconique est aussitôt devenue une pièce culte et a été portée par de nombreuses célébrités et fashion blogueuses. Ils ont également travaillé sur de nombreuses collaborations, notamment celle avec H&M publiée en novembre 2016, qui a apporté à la marque une popularité mondiale.
